Video: Je, contigs hukusanywaje kwenye scaffolds?
2024 Mwandishi: Miles Stephen | [email protected]. Mwisho uliobadilishwa: 2023-12-15 23:41
Wakati wa kuunda rasimu ya jenomu, usomaji wa mtu binafsi wa DNA ni wa kwanza wamekusanyika katika contigs , ambayo, kwa asili yao mkusanyiko , kuwa na mapungufu kati yao. Hatua inayofuata ni kwa kisha punguza mapengo kati ya haya contigs kwa tengeneza a kiunzi . Hii inaweza kufanywa kwa kutumia ramani ya macho au mpangilio wa jozi-wawili.
Vile vile, unaweza kuuliza, contigs na scaffolds ni nini?
A kiunzi ni sehemu ya mfuatano wa jenomu ulioundwa upya kutoka kwa kloni za shotgun zenye mpangilio wa mwisho. Viunzi zinaundwa na contigs na mapungufu. A contig ni urefu unaoshikamana wa mfuatano wa jeni ambapo mpangilio wa besi unajulikana kwa kiwango cha juu cha kujiamini. Katika baadhi ya kesi, scaffolds inaweza kuingiliana.
Pia, contigs ni nini katika bioinformatics? A contig (kutoka kwa kuunganishwa) ni seti ya sehemu za DNA zinazopishana ambazo kwa pamoja zinawakilisha eneo la makubaliano ya DNA. Contigs kwa hivyo inaweza kurejelea mfuatano wa DNA unaopishana na sehemu za kimwili zinazopishana (vipande) vilivyo katika miiko kutegemea muktadha.
Katika suala hili, contigs hukusanywaje?
Seti ya mfuatano wa DNA unaopishana wa vipande vya DNA inajulikana kama a contig . Contig uchoraji wa ramani ni mchakato ambao clones zinazopishana ni wamekusanyika kuratibu mwingiliano huo. Hii inahusisha kupanga contigs kwa mpangilio na mwelekeo. Clone contigs inaweza kuwa moja kwa moja wamekusanyika kwa kutumia mlolongo wao wa mwisho wa BAC.
Kwa nini contigs ni muhimu?
Contig mkusanyiko ni muhimu hatua katika mkusanyiko wa genome. Kwa uchoraji wa ramani, kloni zinazopishana hukusanywa ili kuratibu mwingiliano huo. Kila kipande kimeundwa katika vekta na kupangwa kutoka ncha zote mbili ili kutoa urefu wa mfuatano wa takriban 600-700 bp. Mlolongo kutoka ncha zote mbili za kipande cha DNA huitwa mwisho wa jozi.
Ilipendekeza:
Je, kuna tovuti ngapi za EcoRI kwenye DNA ya lambda?
DNA ya Lambda iliyotumiwa katika jaribio hili imetengwa kama molekuli ya mstari kutoka kwa E. coli bacteriophage lambda. Ina takriban jozi 49,000 za msingi na ina tovuti 5 za utambuzi wa Eco RI, na 7 kwa Hind III
Kwa nini maji huingia kwenye karatasi kuelezea hili?
Maji hupanda karatasi kutokana na hatua ya capillary. Huu ndio wakati uunganishaji wa molekuli za kioevu zenyewe ni chini ya mvuto wa dutu nyingine ambayo molekuli zinagusa. Bitrate ya sodiamu ina ioni ya sodiamu, vikundi vitatu vya hidroksili, na vifungo viwili viwili
Je, Finny anaanguka kwenye ukurasa gani kutoka kwenye mti?
Finny anapendekeza kuruka mara mbili na Gene, na wanavua nguo na kupanda mti. Finny anatoka nje na kwenda kwenye kiungo kwanza, na Gene anapotoka, magoti yake yanainama na kushikanisha kiungo, na kumfanya Finny apoteze usawa wake na kuanguka kwa kishindo cha kuumiza hadi benki
Je, amonia husafirishwaje hadi kwenye ini kutoka kwa mfano kwenye misuli?
Uhifadhi usio na sumu na aina ya usafiri wa amonia katika ini ni glutamine. Amonia hupakiwa kupitia synthetase ya glutamine kwa mmenyuko, NH3 + glutamate → glutamine. Inatokea katika karibu tishu zote za mwili. Amonia inapakuliwa kupitia glutaminase kwa athari, glutamine --> NH3 + glutamate
Je, ni malipo gani kwenye cathode kwenye seli ya electrochemical?
Ya sasa kutoka kwa chanzo cha nguvu husukuma elektroni kwenye elektroni iliyo upande wa kulia wa mchoro, ambapo husababisha kupunguzwa kwa spishi - kwa hivyo elektroni hii ni cathode. Katika seli za electrolytic, cathode inashtakiwa vibaya. Elektroni zinasukumwa kwenye cathode na chanzo cha nguvu cha nje